方惟深著有《方秘校集》十卷，其诗精谐警绝，很受王安石赏识，谓唐代诗人元（稹）、白（居易）、陆（龟蒙）、皮（日休）有不到处。《中吴纪闻》云：“子通（惟深）最长于诗，凡有所作，王荆公读之，必称善，谓深得唐人句法。”方惟深有首《谒荆公不遇》诗写道：春江渺渺抱樯流，烟草茸茸一片愁。吹尽柳花人不见，春旗催日下城头。此诗通篇四句，全部采用熔情入景、以景写情的手法，虽无一字直接明写作者访人不遇的怅惘之情，但通过春江、归帆、烟草、柳花、春旗、落日等来渲染和衬托自己的强烈思想，使全诗情景交融，浑然一体，深得唐人风致。据《中吴纪闻》载：“此诗荆公亲书方册间，因误载《临川集》（王安石文集）。”可见王安石对此诗十分喜爱。

方惟深还有一首《舟下建溪》诗，亦得“荆公爱之，尝书坐右，后人误入荆公集中”（郑岳《莆阳文献》）。其诗云：客航收浦月黄昏，野店无灯欲闭门。倒出岸沙枫半死，系舟犹有去年痕。这是一首描写旅途夜泊的七言绝句。诗中选用最有特征的景物，写出荒村月夜泊舟的静谧境界。诗人通过精心选材，巧妙构思，虽是信笔直书，却使人感到如临其境。诗中开头的“客航收浦月黄昏”化用林逋《山园小梅》“暗香浮动月黄昏”诗句，“野店无灯欲闭门”则化用韦应物《滁州西涧》的名句“野渡无人舟自横”，皆不露痕迹，另出新意，隽永可爱。据《中吴纪闻》云：“子通（惟深）游王氏之门，初无迎合意，后隐城东故庐，与乐圃先生皆为一时所高。每部使者及守帅下车，必即其庐而见之。前后上章论荐者甚众，竟绝禄仕意。僧仲殊赠诗有‘依旧凄凉无长物，只余松桧养秋风’之句，可以见其清高矣。”