明崇祯十年（1637年）进士，官御史。尝劾辅臣谢升，又熊开元参周延儒遭廷杖，溶疏白其冤。
清顺治元年（1644年）清兵入北京后仕清，初授原官，起用河南道御史，任顺天学政督学顺天，为清王朝献策，疏陈定官制，定屯田、盐法、钱法规制，禁兵丁将马践食田禾，巡缉土贼，平粜以裕仓储，设兵循徼等事，使无劫掠。其疏陈皆被采纳实施。又就有关科举、荐举隐逸、访旌殉节者等问题向朝廷献策。
顺治三年（1656年）二月充会试监考官，三月迁太仆寺少卿。不久，因在学政任上所举贡生中有明代受世袭职和中武举者一事被发现，降两级调用。接着又因选拔贡生超额被革职回籍。
顺治十一年（1654年）官复原职，迁左通政。次年三月擢左副都御史，旋擢户部右侍郎，左迁广东右布政使。
顺治十三年（1656年）以举动轻浮，降一级改任山西阳和道。遭丧归里。服除，补山西按察副使，备兵大同。
康熙三年（1664年）裁缺归里。康熙十三年（1674年）三藩之乱发生后，阁臣以边才荐，随征福建。丁忧不复出。
康熙十七年（1678年）诏举博学鸿词，大学士李霨、杜玄德、冯溥合疏荐曹溶，未试，以疾辞。康熙十八年（1679年）举鸿博，不赴。
康熙十九年（1680年），学士徐元文荐曹溶佐修《明史》，亦不赴。康熙二十四年（1685年）卒。